Спустя четыре года после того, как заклинание стерло память мира о Питере Паркере, он живет в полном одиночестве в Нью-Йорке, снимая небольшую комнату. Никто из прежних знакомых — ни Эм-Джей, ни Нед, ни даже Доктор Стрэндж — не помнит, кто он такой, и Питер сознательно держится в стороне от их жизни. Он полностью посвящает себя борьбе с преступностью, став Человеком-пауком на постоянной основе: налаживает рабочие отношения с детективом Джин Девулфф, очищает город от множества преступников и даже получает символический ключ от города. Неожиданным союзником становится Каратель, с которым у него складываются своеобразные отношения. При этом он продолжает издалека наблюдать за Эм-Джей и Недом через социальные сети, видя, как они строят новую жизнь без него.
Постоянная жизнь в авральном режиме и накопившийся стресс вызывают биологическую эволюцию в его организме: он неожиданно обретает способность генерировать паутину, а привычное паучье чутье начинает давать сбои. На этом фоне Нью-Йорку угрожает загадочный противник, которого практически невозможно вычислить: он не выходит на улицы сам, а действует чужими руками, захватывая сознание людей и превращая их в марионеток. Единственным, на кого эта способность не действует, оказывается Питер Паркер. Когда неизвестные угоняют танк, Человек-паук вмешивается, но сталкивается с этим новым врагом лицом к лицу. В ходе противостояния он также пересекается с Брюсом Беннером, пытающимся помочь ему обуздать нестабильную природу, и с молодой Джин Грей, чья сила перекликается с его собственной драмой. Питер оказывается перед судьбоносным выбором: либо навсегда исчезнуть, либо вернуть свое имя, балансируя на грани между человечностью и аномалией.
